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取消手机银行短信费并不一定会自动卸载手机银行应用。关于安全性问题，主要取决于以下几个方面。
1、操作流程：取消短信费的操作需要在手机银行应用中进行，按照正常流程操作是安全的，如果在操作过程中遇到任何不寻常的提示或警告，例如要求输入额外的验证信息或下载未知来源的文件，应当格外小心。
2、卸载与费用关系：卸载手机银行应用与短信费用并无直接关系，即使取消了短信费，除非自己主动卸载，否则应用通常会继续留在手机上。
3、安全设置：为了确保安全，建议在使用手机银行时，确保手机的安全设置已经更新到最新，并只使用官方正版的应用商店下载应用，不要在任何不可靠的网络环境下进行敏感操作，如公共Wi-Fi。
取消手机银行短信费不会存在安全风险，但无论是否取消费用，都要确保个人信息安全和遵循正确的操作流程，如果担心安全问题或不确定如何操作，建议联系银行客服以获取帮助。